Liên minh HTX có chức năng:

1) Đại diện và bảo vệ quyền, lợi ích hợp pháp của các thành viên;

2) Tuyên truyền, vận động phát triển HTX, liên hiệp HTX;

3) Tư vấn, hỗ trợ và cung cấp dịch vụ, đào tạo, bồi dường nẹuồn nhân lực phục vụ cho việc hình thành và phát triển của HTX, liên hiệp HTX;

4) Thực hiện các chương trình, dự án, dịch vụ công hỗ trợ phát triển IITX được giao;

5) Tham gia xây dựng chính sách, pháp luật HTX, liên hiệp IỈTX;

6) Đại diện cho các thành viên trong quan hệ hoạt động phối hợp với các tổ chức trong nước và nước ngoài theo quy định của pháp luật.